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环境科学与工程系严格执行学院教学管理与质量监控等方面的规章制度，并结合环境科学与工程系专业特点，制定了具体的落实措施及实施细则，执行情况良好。相关制度如下：

1. 实践教学管理规定

环境科学与工程系制定有《环境科学与工程系环境科学与工程专业学生专业实习实施细则》、《环境科学与工程系环境科学与工程专业学生毕业实习计划》、《环境科学与工程系环境科学与工程专业学生实习大纲》、《环境科学与工程系环境科学与工程专业本科毕业（论文）设计管理规定》等4个实践教学管理规定。

2. 实验室管理制度

环境科学与工程系制定有《环境科学与工程系实验室安全管理制度》、《环境科学与工程系实验室管理员守则》、《环境科学与工程系分光光度室管理制度》、《环境科学与工程系环境监测实验室管理制度》、《环境科学与工程系环境土壤实验室管理制度》、《环境科学与工程系环境微生物实验室管理制度》、《环境科学与工程系原子吸收室管理制度》等17项实验室管理制度。